量化基金公司是利用数学模型和计算机算法进行投资决策的机构，其投资策略相对传统基金更加机械化和自动化。然而，有时候量化基金公司也可能存在一些不当行为或违规操作，需要进行惩治。以下是一些可能的措施：
监管部门应当加强对量化基金公司的监管力度，确保其遵守相关法规和规定。监管部门可以对量化基金公司的交易行为、算法模型等进行审查，发现问题及时进行处理。
量化基金公司应当提高透明度，公开其投资策略、算法模型、交易记录等信息，让投资者和监管部门能够更好地了解其运作情况。透明度可以减少潜在的违规行为。
量化基金公司应当建立健全的内部控制制度，包括风险管理、合规监督等方面。公司应当设立独立的风险管理部门，对投资策略和交易进行监控，及时发现和纠正问题。
对于发现的违规行为，监管部门应当依法进行处罚，包括罚款、暂停业务、吊销执照等措施。这样可以对违规行为进行惩治，维护市场秩序。
监管部门应当加强对投资者的保护，包括加强信息披露、提供投诉渠道等措施。投资者应当了解量化基金公司的运作方式和风险，做出理性的投资决策。
惩治量化基金公司需要综合运用监管、透明度、内部控制、处罚和投资者保护等手段，以确保市场秩序的正常运转，保护投资者的合法权益。
